La Autoridad de Cuencas fue creada por ley provincial N° 10941 con el objetivo de diseñar e implementar acciones para la reducción, mitigación y saneamiento de toda actividad antrópica que, de manera directa o indirecta, constituya fuente de impacto ambiental en los embalses de la provincia y sus cuencas.
Encontrándose entre sus funciones principales:

● Diseñar e implementar acciones para la reducción de la afectación y saneamiento de los embalses de la provincia y sus cuencas.

● Diagnosticar, estudiar y promover la ejecución de soluciones técnicas.

●Instar a los distintos sectores de la comunidad a colaborar con el diseño e implementación de políticas públicas, procurar acuerdos entre los sectores involucrados sobre el diseño, desarrollo y organización para la implementación de acciones.

A fin de dar cumplimiento a lo indicado, la Autoridad de Cuencas, cuenta con una Dirección Técnica, integrada por un representantes del Gobierno de la Provincia de Córdoba, con el objetivo de brindar asistencia y fundamentación técnica a las decisiones del Presidente; y un Órgano Consultivo Permanente, integrado por representantes del sector académico, del Instituto Nacional del Agua (INA – CIRSA) u otro organismo que se requiera al efecto.
Asimismo, para una mayor organización y alcance de las acciones que desarrolla la Autoridad se han creado, mediante Res. N° 2/2024, tres Unidades de Gestión: Cuenca Lago San Roque, Cuenca Dique Los Molinos, Cuenca Embalse de Río Tercero.